صندوق تعاون کارکنان دانشگاه قم با الهام از تعاليم عالي اسلام و با استمداد از توجهات حضرت بقيه ا... الاعظم امام زمان حجه بن الحسن العسکري (عجل ا... تعالي فرجه الشريف) به منظور انجام خدمات عامالمنفعه، رفع نيازهاو بهبود وضع معيشت اعضاء با حفظ موازين شرعي و رعايت قوانين و مقررات جاري جمهوري اسلامي ايران، توسط شوراي مرکزي و کميته رفاهي شوراي صنفي کارکنان دانشگاه قم، به عنوان هياتموسس، در سال 1388 تأسيس شده و از ابتداي سال 1389 فعاليت خود را آغاز کرده است.
ارکان صندوق مجامع عمومي، هيأت مديره و بازرس صندوق مي باشد. فعاليت صندوق در چارچوب اساسنامه و شيوه نامه اعتباري آن انجام مي شود. تصميم گيري و برنامه ريزي صندوق در مجامع عمومي توسط اعضاي صندوق انجام شده و اعضاي هيأت مديره و بازرس صندوق که توسط اعضا انتخاب مي شوند اداره صندوق را برعهده دارند. مديرعامل صندوق توسط هيأت مديره انتخاب شده و عامل اجرايي اصلي صندوق مي باشد.
در حال حاضر بيش از 70 درصد کارکنان دانشگاه و 20 درصد از اعضاي هيأت علمي عضو صندوق بوده و صندوق داراي عضو 345 فعال مي باشد. صندوق تعاون دانشگاه قم، پس از 7 سال فعاليت تواسنته است نماد واقعي تعاون و همکاري در مجموعه دانشگاه باشد . چهارمين هيأت مديره صندوق، پس از برگزاري انتخابات در 15ارديبهشت 1395 فعاليت خود را آغاز کرده است.
سومين دوره کاري صندوق از 15 خردادماه 1393 شروع شده است و تا سال 1397 ادامه دارد. در هر دوره کاري صندوق تمامي اعضا يکبار از تسهيلات وام عادي صندوق به قيد قرعه استفاده مي کنند.